氣相色譜系統中，載氣的作用之一是將樣品載入儀器系統進行分離和測定，另一個重要作用是保護儀器。常用的載氣，按照如
He、H2、N2、Ar等。載氣種類不同，會導致分析結果不同。
首先載氣對柱效的影響主要表現在組分在載氣中的擴散系數上，而組分在載氣中的擴散系數又影響分子的縱向擴散項系數和氣相傳質項系數，從而影響柱效和分析時間。
根據Van Deemter方程可知：
①渦流擴散項A與載氣流速無關；
②當載氣流速小時，分子擴散項對柱效的影響是主要的，因此選用分子量較大的載氣，如氮氣、氬氣，可使組分的擴散系數較小，從而減小分子擴散的影響，提高柱效；
③當載氣流速較大時，傳質阻力項對柱效的影響起主導作用，因此選用分子量較小的氣體，如氫氣、
氦氣作載氣可以減小氣相傳質阻力，提高柱效。
因此，要使理論塔板高度最小、柱效最高，必有一最佳流速最佳。
由于氫氣有一定危險性的易燃、易爆氣體，在強調分析速度時，可選擇氫氣作載氣，但必須在符合檢測器工作要求并保證安全的前提下使用。
常用氣相色譜分析選擇載氣推薦：
熱導池檢測器通常選用氫氣或
氦氣、電子捕獲檢測器(ECD)常用高純氮氣或氬氣作載氣、氫火焰離子化檢測器(FID)常用分子量大的氮氣作載氣、脈沖式火焰光度檢測器(PFPD)，氮氣、
氦氣、氫氣都可用作載氣，其中PFPD 要優化硫、磷的響應，可選擇氫氣作載氣，用合適的富氫火焰，但要注意安全。
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