正常來說，同位素質譜儀是為測定自然豐度的樣品同位素比值而設計的儀器，具有極高的靈敏度。一般情況下，我們不建議長期為測定標記物質而使用。如果要測定標記物質，我們建議將標記同位素的最高豐度控制在10atom%左右。

建議在測試時，更換全新的反應管，一定要與做非標記物質的反應管分開。測試樣品時，按照標記豐度，依次從低到高測試。測試結束后，烘烤色譜柱過夜，烘烤離子源，烘烤針閥，烘烤分析器。再切換回做自然豐度樣品時，先做空白，確保空白無污染后再進行測試。

在某些情況下，當你的測試樣品豐度過高，超過儀器的量程時（出現平頂峰），可以通過更換高阻來調節。例如測定高豐度的15N的N2O氣體時，接收M/Z 45峰的法拉第杯放大器的高阻值可以從3X1010Ω降至3X109Ω，以降低信號強度；測定豐度極高的15N2時，除了降低接收M/Z 29峰放大器的高阻值外，還必須相應降低M/Z 30接收杯放大器的阻值，由1X1011Ω降至1X109Ω。具體詳情還需要根據儀器型號考慮。